Η σχολή Gyokushin Ryu Ninjutsu είναι παρακλάδι της Kosshijutsu και ως ιδρυτής της σχολής εικάζεται ο Sasaki Goeman Teruyoshi, εξέχον μαθητής της Gyokko Ryu, λόγος που εξηγεί γιατί οι μέθοδοι της Gyokushin Ryu (φραγμοί, χτυπήματα και στάσεις) μοιάζουν πολύ με αυτές της Gyokko Ryu.

Ο δεύτερος Soke της Gyokushin Ryu, Sasaki Gendayu, γιος του Sasaki Goeman Teruyoshi, ήταν στην υπηρεσία του Daimyo της Kishu με ετήσια αμοιβή 200 Koku (ένα Koku ήταν αρκετό να ταΐσει ένα άτομο για ένα έτος), αργότερα μάλιστα 400 Koku, γεγονός που δείχνει, ότι και αυτός ήταν πολύ ικανός και καταρτισμένος στην Gyokko Ryu, όπως ο πατέρας του.

Η σχολή Gyokushin Ryu διδασκόταν μυστικά στα φέουδα Kishu και Takeda. Κάποια στιγμή του 17ου αιώνα ήρθε σε επαφή με την Togakure Ryu και την οικογένεια Toda. Όταν η σχολή πέρασε στα χέρια του Toda Nobutsuna, αναμίχθηκε με άλλα συστήματα και σταμάτησε να κρατιέται πια μυστική. Παρ’ όλα αυτά όμως ακόμα και σήμερα οι τεχνικές της σχολής αυτής παραμένουν άγνωστες στον δυτικό κόσμο. Οι φήμες λένε ότι είναι περισσότερο εξειδικευμένο για κατασκοπεία και άλλες ειδικές δεξιοτεχνίες του Ninjutsu (ιδιαίτερα στις ρίψεις αυτοθυσίας), παρά για μάχη. Γνωστή όμως είναι η χρήση του Nagenawa (λάσο) στην Gyokushin Ryu.

Επίσης κυκλοφορούν φήμες, ότι ο Takamatsu Sensei, φίλος του ιδρυτή του Judo Kano Jigoro, δίδαξε τεχνικές της Gyokushin Ryu σαν καλεσμένος εκπαιδευτής στο Kodokan. Το γεγονός αυτό γίνεται πιστευτό από τις μαρτυρίες κάποιου Mochizuki που γεννήθηκε το 1907 και άρχισε την εκπαίδευση του στο σε ηλικία 5 χρονών. Σπούδασε πολλά συστήματα μεταξύ των οποίων και το Gyokushin Ryu Jujutsu. Σε ηλικία 26 χρονών μπήκε στο Kodokan σαν μαθητής του Jigoro Kano και έφθασε να κατέχει το 8ο Dan. Αναφέρει λοιπόν ο Mochizuki ότι οι τεχνικές αυτοθυσίας (Sutemi) που συμπεριέλαβε και δίδαξε στο Yoseikan (σύστημα βασισμένο στο Judo, Aikido, Karate και Katori Shinto Ryu και που ίδιος δημιούργησε) προέρχονται από την Gyokushin Ryu.

Ο Mochizuki ήταν επίσης μαθητής του Mifune Kyuzo, προσωπικού μαθητή του Ueshiba Moritaka, ιδρυτή του Aikido. Μέσω του Mifune έγινε στενός φίλος και μαθητής του Ueshiba, που έγινε τακτικός επισκέπτης στο σπίτι των Mochizuki και κάποια μέρα του παρουσίασε τα δυο παρακάτω Makimono: 1). Το Daito Ryu Aikibujutsu, ένα αντίγραφο του Daito Ryu Aikijutsu Hiden Mokuroku Makimono που εκδόθηκε από τον επί κεφαλής της Daito Ryu Sokaku Takeda, που δεν ζει πια σήμερα, και 2). Το Hiden Oesi, ένα αντίγραφο του πάπυρου του πιο υψηλού επιπέδου της Daito Ryu. Και τα δύο υπογράφονται και χρονολογούνται Showa Roku Nen, Roku Gatsu (Ιούνιος 1932), Ueshiba Moritaka, σπουδαστής του Takeda Sokaku και φέρουν επίσης τη σφραγίδα του Aikijujutsu.

Η δομή της Gyokushin Ryu

Ο Hatsumi Sensei δεν έχει διδάξει ως σήμερα ανοιχτά την σχολή αυτή

Οι Soke της Gikan Ryu

 Όνομα (Περιοχή) Εποχή Χρονολογία
1.  Sasaki Goeman Teruyoshi
2.  Sasaki Gendayu Sadayasu
3.  Άγνωστο ή μυστικό
4.  Άγνωστο ή μυστικό
5.  Άγνωστο ή μυστικό
6.  Άγνωστο ή μυστικό
7.  Άγνωστο ή μυστικό
8.  Άγνωστο ή μυστικό
9.  Άγνωστο ή μυστικό
10. Άγνωστο ή μυστικό
11. Toda Seiryu Nobutsuna Kenei (1624 – 1644)
12. Toda Fudo Nobuchika Manji (1644 – 1661)
13. Toda Kangoro Nobuyasu Tenna (1681 – 1704)
14. Toda Eisaburo Nobumasa Hoyei (1704 – 1711)
15. Toda Shinbei Masachika Shotoku (1711 – 1736)
16. Toda Shingoro Masayoshi Gembun (1736 – 1764)
17. Toda Daigoro Chikahide Meiwa (1764 – 1804)
18. Toda Daisaburo Chikashige Bunkwa (1804)
19. Toda Shinryuken Masamitsu (Kobe) Meiji (1824 – † 1909)
20. Takamatsu Toshitsugu (Nara) Meiji (1887 – † 1972)
21. Hatsumi Masaaki (Noda) Showa (1931 – σήμερα)